L'ateneo è guidato dal rettore che ne è il rappresentante legale. Il rettore è coadiuvato da una prorettrice vicaria, da delegati e referenti a cui sono affidati compiti specifici.
Insieme al rettore, il senato accademico e il consiglio di amministrazione definiscono le politiche e le strategie dell'ateneo e individuano azioni per il loro conseguimento
Sono inoltre organi statutari: il direttore generale, il nucleo di valutazione, il presidio della qualità, il collegio dei revisori dei conti, il senato degli studenti e il comitato unico di garanzia.
Collaborano al governo dell'ateneo gruppi di lavoro, comitati e commissioni.