La direzione della Scuola di dottorato rappresenta la scuola nei rapporti interni ed esterni, coordina e sovrintende alle attività della scuola e presiede il consiglio. Da novembre 2021 è direttrice della Scuola Maria Chiara Tosi che ha nominato come vice-direttrice e responsabile del Laboratorio di scrittura Maria Bonaiti. Hanno diretto la Scuola Alberto Ferlenga (2008–2015, poi eletto rettore) e Benno Albrecht (2015–2021, poi eletto rettore). 

Il Comitato di direzione supporta la direzione della scuola nello svolgimento delle sue funzioni ed è costituito dai responsabili scientifici degli ambiti di ricerca:

e da due rappresentanti dei dottorandi e delle dottorande

Partecipa inoltre alle sedute Sara Marini come referente del percorso interdisciplinare C.SCARPA

Nelle sedute del Collegio docenti e del Consiglio della Scuola si definiscono il progetto del corso di dottorato per l’accreditamento quinquennale e il rinnovo annuale; si individuano i responsabili scientifici degli ambiti; si curano le attività didattiche e di ricerca, si curano i rapporti con altre istituzioni proponendo accordi e convenzioni agli organi di governo. 

Due rappresentanti delle dottorande e dei dottorandi vengono eletti ogni due anni tra gli iscritti al corso di dottorato e partecipano di diritto alle riunioni del collegio dei docenti e del comitato di direzione. Per il biennio 2024/2026 sono state nominate:

Il supporto amministrativo e di segreteria viene garantito dal Servizio formazione alla ricercache cura tutte le attività inerenti alla gestione della scuola di dottorato e dei correlati servizi didattici e di formazione alla ricerca.

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