La sede è presso l’ex cotonificio a Santa Marta. L'edificio fu inaugurato nel 1883. L'anno precedente, per iniziativa del barone Eugenio Cantoni e del cavaliere Carlo Moschini, si era costituita una società che aveva lo scopo di esercitare a Venezia la filatura del cotone. Parzialmente distrutto da un incendio nel 1916, fu ricostruito.

Lo stabilimento, in cui  lavoravano circa mille operai,  rimase in funzione fino al 1960. Restaurato dallo studio veneziano di Gino Valle, l'edificio principale ospita oggi una parte considerevole dell'Istituto Universitario di architettura: aule didattiche, il Dipartimento di Progettazione Architettonica e l'Archivio Progetti.

La parte riservata all'archivio comprende una sala studio con nove posti di consultazione, la sala espositiva, un ufficio e un deposito.  Nella sala espositiva è allestita in permanenza una mostra di modelli che appartengono alla raccolta dell'archivio, e vengono organizzate mostre temporanee nelle quali si espongono documenti originali provenienti dai fondi.